国家棉花产业技术体系乌鲁木齐综合试验站是根据农业农村部部署，2008年正式运行，依托单位为新疆维吾尔自治区农业科学院农业资源与环境研究所，是结合新疆棉花产业特点设立的区域性综合试验站，主要围绕棉花营养与施肥、农业资源高效利用、土壤利用与改良、智能水肥一体化管理、耕作与栽培、新品种引进筛选、病虫害防治等开展研究示范与技术服务，在哈密、鄯善、昌吉、玛纳斯、新湖农场建立5个示范县，并建有多个示范基地。
多年来，试验站紧紧围绕棉花产业发展需求，整合优势资源进行棉花生产技术的集成、试验和示范；调查、收集、分析棉花的产业及其技术发展动态与信息，为服务示范县提供棉花生产技术服务，针对农民再生产过程中急需的栽培、施肥、灌溉等技术进行培训。与服务县范围内的企业或合作社等开展了形式多样的对接与服务，联合企业、推广培训机构、新型农业经营主体等多方力量，建立科技创新联合体，以县域为实施单元，开展定向合作、定向攻关、定向集成，创建节本降耗、绿色增产、提质增效和循环利用等技术模式，提高标准化、品牌化、信息化水平，推动产业转型升级，提高质量效益和竞争力。
